Σε αυτό το manga, οι πρωταγωνιστές Gold και Silver είναι δύο νεαροί προπονητές που ξεκινούν την περιπέτειά τους στην περιοχή Johto. Καθώς προχωρούν στην πορεία τους, συναντούν διάφορους αντιπάλους, φίλους και Pokemon, ενώ ερευνούν τα μυστικά της περιοχής και αναζητούν τους θρύλους των Legendary Pokemon. Η περιπέτειά τους τους οδηγεί να αντιμετωπίσουν πολλούς κινδύνους και να αναδείξουν την αληθινή δύναμη της φιλίας και της αφοσίωσης.